La Copa Merconorte se hizo en similitud con la Mercosur, cobijando en este caso a los equipos del norte de América del Sur junto a representantes mexicanos como invitados.En la primera edición en el año 1998, desavenencias entre la Federación Mexicana y la Conmebol en cuanto a cuales clubes debían participar, terminó con la drástica decisión por parte del organismo sudamericano de realizar el torneo sin los equipos de México. Planeada para ser disputada por 16 equipos, la Copa del 98 acabó siendo jugada por apenas 12 clubes.
Ambas copas, Merconorte y Mercosur, terminaron supliendo en el calendario de la Confederación Sudamericana de Fútbol a la Copa Conmebol.
